Japan-Places.com перечислил около 1013 университеты в Япония. Некоторые из лучших университеты в Япония являются- Центр Хёго Кенрицу Дайгакутэнмонкагаку Обсерватория Нишихарима, Университет Цукуба, Университет Рицумейкан - Кампус Кингаса, Токийский медицинский и стоматологический университет, Нагойский университет, Йокогамский национальный университет, Йокогамский национальный университет, Йокогамский национальный университет, Университет Хитоцубаси & Университет Хитоцубаши.