Japan-Places.com перечислил около 824 Ботанические сады в Япония. Некоторые из лучших Ботанические сады в Япония являются- Фруктовый парк Тогокусан, Альпийский ботанический сад Рокко, Ботанический сад Мияко Циндао, Розарий Хигасидзава, Сад роз Хигасидзава, Купол тропической оранжереи Юмэношима, Купол тропической оранжереи Юмэношима, Сад Ираго Нанохана, Парк Суиго Савара Аяме & Музей тропических растений Итабаши.